Het bestuur van de LLTB is, in tegenstelling tot de Ledenraad, niet-vertegenwoordigend. Dat wil zeggen dat de samenstelling van het bestuur niet automatisch wordt bepaald door de structuur van vakgroepen en afdelingen. Om vernieuwing te stimuleren werkt het bestuur met een maximale zittingsduur en met een rooster van aftreden. De beleidsthema's of aandachtsgebieden van het bestuur zijn onderling verdeeld in zogenaamde portefeuilles.

Het bestuur wordt bij de uitvoering van haar taken ondersteund door een werkorganisatie onder leiding van directeur Wim van de Belt. In totaal zijn 48 mensen bij de LLTB in dienst, van wie het merendeel in deeltijd. Dit levert een bezetting op van 37 fte.